För det första har Handledning för internationell beskattning (SKV 352) inarbetats i handledningen och ges inte längre ut. Nationella och internationella aspekter på en viss fråga behandlas nu i samma handledning, i många fall även i samma avsnitt. Till övervägande del har inarbetningen skett genom att hela avsnitt flyttats från Handledning för internationell beskattning. Vissa avsnitt som hänför sig till flera olika delar av inkomstskattelagen har emellertid delats upp och inarbetats på flera olika ställen i handledningen. Sådana avsnitt saknar alltså direkt motsvarighet i årets handledning. Det gäller till exempel avsnitt 12 Bostadsbeskattning i 2011 års utgåva av Handledning för internationell beskattning.

För det andra har handledningens grundläggande struktur ändrats. Som en följd av den nya strukturen har ordningsföljden mellan avsnitten ändrats på många punkter. Vidare har avsnittsnumreringen ändrats så att den nu löper i en obruten följd genom hela handledningen.